（一）綜合處
承擔本司工作計劃和綜合文稿起草、會議組織、公文運轉、文書檔案、政務信息、督查督辦、信訪安全保密、資產管理、信息化、黨群和其他日常行政事務等工作。承辦領導交辦的其他工作。
（二）安全評估處
承擔全國產品質量安全狀況評估和研判工作。建立行業、區域質量安全風險監控機制，實施分類監管、質量安全追溯制度。擬訂全國重點監督產品目錄。承辦領導交辦的其他工作。
(三)監督抽查處
擬訂生產和流通領域產品質量監督抽查制度，組織開展產品質量國家監督抽查工作,指導地方開展產品質量監督抽查工作。組織協調行業和專業性監督抽查工作。承辦領導交辦的其他工作。
(四)生產許可和工業品監管處
擬定工業產品生產許可和工業品質量安全監管制度。指導和監督省級生產許可審批發證工作。組織和指導開展重點行業、區域的工業品質量安全專項整治。配合開展成品油等質量監管工作。承擔食品相關產品生產許可管理工作。承辦領導交辦的其他工作。
(五)消費品監管處
擬訂消費品質量安全監管制度，建立運行消費品質量安全風險快速預警系統，組織和指導開展重點行業、區域的消費品質量安全專項整治。承辦領導交辦的其他工作。
(六)食品相關產品和棉花監管處
擬訂食品相關產品安全監管制度，參與制訂并組織實施國家食品相關產品風險監測計劃，指導地方開展食品相關產品監督檢查工作。擬訂棉花等纖維質量監督制度，指導棉花等纖維質量監督檢查工作。監督棉花等纖維質量公證檢驗工作。管理棉花等纖維質量公證檢驗的監督抽驗工作。承辦領導交辦的其他工作。